期刊简介

               本刊是昆明医学院主办,云南省教育厅主管的综合性学术期刊,为季刊、国内外公开发行。本刊主要报道我省及我院基础医学、临床医学、药学、预防医学领域的最新研究成果,辟有论著、综述、个案报道、短篇报道及经验交流等栏目,旨在促进医学信息交流,为发展祖国的医药卫生事业服务。                

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  • 杂志名称:昆明医科大学学报杂志
  • 主管单位:云南省教委
  • 主办单位:昆明医学院
  • 国际刊号:1003-4706
  • 国内刊号:53-1221/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:全国优秀科技期刊期刊收录:维普收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 万方收录(中), CA 化学文摘(美), 上海图书馆馆藏, 知网收录(中), 国家图书馆馆藏
昆明医科大学学报杂志2014年第11期

hsa-miR-126的靶基因预测及功能分析

陈波;者明伟;廖泽容;徐天勇;卢敏南;赵洪波

关键词:hsa-miR-126, 微小RNA, 生物信息学, 靶基因, 功能
摘要:目的 检测hsa-miR-126在各个组织器官中的表达情况,通过生物信息学预测hsa-miR-126的靶基因,进一步分析其可能功能,为研究hsa-miR-126的功能和机制奠定基础.方法 通过miRGator v3.0数据库查看hsa-miR-126在各个组织器官中的表达丰度情况;应用TargetScan、DIANA-microT-CDS及miRanda预测hsa-miR-126的靶基因;将预测所得靶基因和已证实的靶基因交集组成的基因集合分别进行功能富集分析(GO analysis)和信号转导通路富集分析,分析hsa-miR-126的可能功能.结果 hsa-miR-126在胃肠道,心脏,肾脏,肝胆系统,肺,干细胞,睾丸,胸腺,甲状腺,子宫中表达丰度较高;结合已被证实靶基因得到40个候选靶基因;靶基因主要参与细胞迁移调控以及腺体发育相关生物过程,涉及数个癌症通路和与癌症发生相关的信号通路,以及神经营养因子信号通路,ErbB信号通路,趋化因子信号通路和VEGF信号通路等.结论 hsa-miR-126预测的靶基因集合富集于多个生物学过程,与肿瘤和血管性疾病密切相关,生物信息预测结果为今后的研究奠定了基础.